背景の青は右下に向かってもっと白くてもいいかもしれません。
あと髪の毛の影の彩度が低い気がします。うーん、でも場所によっては色が生きているようなところもあるようだし……もしかして「乗算」ですか？
あと白目の下側に反射光を少し入れると、影になっている中でも少し透明な印象が出るかも……出ないかも……。
すみません。試さないとわからないんです。汗。

ぱっと見、せっかくきれいに線画を入れていっらっしゃるのに
髪の陰影がそのラインにしたがっていないので、
ちょっともったいないかな？と思います。
加えて、上のウメボシトラさんも仰ってますが、
陰の彩度が低いために少し濁った感じが出ているのかも。

もう少し彩度を上げて、今回は背景の色が青なので、
影色には少し青みをプラスした色にしてみると、
画面の全体の色調の統一感が出るし、
色も濁らず綺麗に出ると思いますよ＾＾
その際、綺麗な線画を生かすよう、陰影の入れ方も
細やかに気をつけてあげると完璧と思います！

透明感といってもどの部分に透明感を出したくアドバイス入れてるのかがわからないです。人物？背景？それとも周りに散ってるオブジェクト？

もし全体的であれば個人的には彩度↓、コントラスト↓、明るさ↑とイラストを明るめにしてはいかがでしょうか。

また絵中のブーメランみたいな青いのがなんなのかもよくわかりません。正直要らない気がしました。
舞う葉っぱでしょうか？葉っぱにしてもノイズみたいな加工は個人的には必要ないように思えます。写実ではなく幻想画なのでしたらそうですか、という事で。
風の表現は髪の毛が目に見えてなびいている、とかで充分だと思います。
背景がちょっとアレなので風に吹かれてなびいている場面とはアンバランスな感も受けました。線…


じっと見ると人物を若干不透明度を下げて透明な感じを出しているようにと仰ってるようですがキャラのコントラストが高すぎてあまりそれが活かしきれてない感じも受けました。

簡単な加工ですが軽く明るめにしてみました、人物だけ更に透明にするというのは出来なかったので画像全体を明るめに軽く加工してみましたが雰囲気とか出ましたでしょうか？

イメージと違う！でしたらごめんなさい。

コメントさせていただきます。
少し画像をいじらせていただきました。

まず、肌色が少し濁っているように見えたので少し彩度を高くしました。
私のやり方ではないのですが、前髪に肌の色を少し透けさせると透明感が出ると聞きますので色を入れてみました。同様に、背景の水色を髪の毛先に少し入れました。
それから、ソフトライトを使って色調を少し整えました。
この絵ではしていませんが、目に被さる部分の髪を着色し、下の目の色を少し透けさせるようにするというのもあります。

軽く入れてみただけですので、違いがわかりにくいかもしれません。
また、グラデーションの使用等、色の変化を緩やかにしてみれば透明感が出るのかなという感じもします。
目指している「透明感」とは違うかもしれませんが、こんなやり方もあるよ程度で認識していただければいいと思います。

影に乗算を使うのは色のコントロールが難しくなるので、極力避けた方がいいと思います。先にテクスチャを貼ってしまって、その上から影を乗せたいから「乗算で……」ということでしたら、テクスチャを上のレイヤーに移動して、影は普通に塗った方が綺麗な色にしやすいです。その時にあまり濁らない色を使えば透明感も増すと思います。

こんな感じはどうでしょうか？

画像を複製、全体の彩度をｶﾞｯと低く、明度をあげる
↓
白黒になったレイヤーの顔部分と髪のハイライト部分、背景の上の方をぼんやり消して、元の画像を透かせる
↓
紫色をオーバーレイで薄くかぶせて色のバランスの統一を目論む
↓
あとは通常レイヤで前髪に肌色を乗せたり目の明るい部分を足したり乗算で色味を足したり
↓
最後にレイヤーを結合。複製したものをオーバーレイにして全体を明るく


感じたのは暗い色を使いすぎということでしょうか。
塗る場面にもよりますが、黒に近い色は要所要所で使うくらいが綺麗に仕上がると思います。
また、透明感を出すにあたって低彩度を用いるのはアリだとおもいますが、この絵の低彩度な影色は色を濁らせる原因になってるように感じます。

元の絵より明るくしすぎて、水銀さんの好みではなくなってるかもしれませんが、何か参考になれば幸いです